清雍正元年，大将军年羹尧平息青海叛乱后回到京都。皇帝担心握有军权的年将军功高盖主，以莫须有罪名赐死这位战功显赫的大臣。皇帝的心腹肃仁亲王接受密令，率领御林军统领常玉岗等深夜围攻年府，欲满门抄斩。常玉岗钦佩年将军，愿冒死违抗圣命救出年家后代年戟、年霞飞。年将军夫妇将一对玉蝴蝶挂在两个孩子的胸前，作为成人后兄妹相认的证物，然后夫妻二人饮毒酒而死。常玉岗救出年家后代，杀出重围，逃离京都，一路南下。肃仁派大内高手血滴子步步追杀，欲斩草除根。在武当山，霞飞姑娘从悬崖上跌落，常玉岗只得带年戟逃往嵩山少林寺，后又被发现，只好辗转到泉州。慧空和尚善用笑拳，击败了前来追杀的血滴子，把他们护送到南少林，常玉岗也脱俗为僧。年霞飞在悬崖下被武当门人静姑搭救，从此在她手下学习武艺。雍正十三年，皇帝得知年家后代未除，命大内总管冠平山督促肃仁亲王尽快剪除后患。肃仁、冠平山乔装平民查访年家后代。肃仁之女婷玉也在武当山静姑门下学艺，与年霞飞是师姐妹。肃仁用圈套收霞飞为义女，霞飞不明真相，与婷玉一起为清廷效力。在南少林，法云大师向年戟讲了他的身世。年戟报仇心切，只身入肃王府，因被婷玉、霞飞发现，报仇未成，只得又返回南少林。肃仁通过密探得知年戟下落，随即发兵围剿南少林，把众僧团团围住，企图一举全歼。法云大师、年戟等人力战众清兵。法云大师不幸中暗器而死，年戟也被霞飞、婷玉追至宝塔内。正当年家兄妹杀得难解难分时，一坐禅老僧走下佛龛制止，指着他们胸前的玉蝴蝶讲明了他们的身世和兄妹关系，兄妹相认。婷玉也因痛恨父亲肃仁杀害忠良，表示愿和他们共患难。肃仁与年戟拚杀，婷玉飞身制止，并谴责其父。这时，冠平山向婷玉飞来一毒刀，误中肃仁，肃仁临死前大骂雍正，婷玉等人和赶来相救的常玉岗等人共同杀死了冠平山。这时，南少林的僧人已被清兵杀得所剩无几。年戟、霞飞、婷玉等遵师命出海，以图来日报仇。
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